Fin dall’inizio, l’idea di creare l’Associazione dei Musei dell’Alto Adige è stata promossa in gran parte dalle/dai rappresentanti dei musei meranesi, in particolare dal Museo delle Donne di Merano e dal Museo Civico di Merano, assieme a Castel Fontana e al Museo della Val Gardena.

Nel 2004 presso il Museo delle Donne di Merano si è tenuta la riunione costitutiva dell’associazione. Essa funge da tramite tra la Provincia di Bolzano e i musei indipendenti che ne fanno parte, si propone come rappresentanza apartitica e indipendente e come piattaforma per la soluzione comune delle problematiche specifiche dei musei nella sfera pubblica.

Dal 2004 al 2013 la sede dell’associazione era situata presso il Museo delle Donne di Merano e Sissi Prader ne è stata la Presidente onoraria per diversi anni. Dal 2013 è stata istituita una sede separata presso la Ripartizione provinciale Musei in Pascoli 2/a, a Bolzano. Attualmente ne fanno capo più di 50 musei privati o comunali.