Das Team des Frauenmuseums legt seit Jahrzehnten große Bedeutung auf Netzwerke und hat mit vielen verschiedenen Organisationen lose Verbindungen beziehungsweise wiederkehrende Zusammenarbeit – auf lokaler, nationaler und internationaler Ebene.

In dauerhafter Zusammenarbeit eingebunden ist das Frauenmuseum bei IAWM  und beim Museumsverband Südtirol.